Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnab1P63143 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms