Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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