Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2bP62915 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2bP62915 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms