Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3P62908 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3P62908 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps3P62908 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps3P62908 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps3P62908 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps3P62908 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps3P62908 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms