Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab3cP62823 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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