Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsnl1P62761 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms