Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hpcal1P62748 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms