Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbpl1P62340 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tbpl1P62340 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms