Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms