Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SnrpfP62307 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpfP62307 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms