Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufm1P61961 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms