Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms