Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Depdc5P61460 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Depdc5P61460 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Depdc5P61460 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Depdc5P61460 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Depdc5P61460 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Depdc5P61460 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Depdc5P61460 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Depdc5P61460 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Depdc5P61460 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Depdc5P61460 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Depdc5P61460 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Depdc5P61460 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Depdc5P61460 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Depdc5P61460 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms