Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms