Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms