Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd4P58467 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd4P58467 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd4P58467 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd4P58467 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd4P58467 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd4P58467 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd4P58467 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd4P58467 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd4P58467 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd4P58467 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Setd4P58467 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms