Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CtnsP57757 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtnsP57757 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtnsP57757 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtnsP57757 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CtnsP57757 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtnsP57757 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtnsP57757 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtnsP57757 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtnsP57757 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtnsP57757 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtnsP57757 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms