Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NcstnP57716 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NcstnP57716 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NcstnP57716 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NcstnP57716 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms