Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bace1P56818 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace1P56818 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace1P56818 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bace1P56818 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace1P56818 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bace1P56818 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms