Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TdgP56581 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TdgP56581 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TdgP56581 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TdgP56581 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TdgP56581 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TdgP56581 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TdgP56581 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TdgP56581 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TdgP56581 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TdgP56581 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TdgP56581 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TdgP56581 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TdgP56581 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TdgP56581 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TdgP56581 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TdgP56581 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TdgP56581 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TdgP56581 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TdgP56581 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TdgP56581 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TdgP56581 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TdgP56581 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TdgP56581 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TdgP56581 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TdgP56581 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TdgP56581 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TdgP56581 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TdgP56581 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TdgP56581 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TdgP56581 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TdgP56581 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TdgP56581 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TdgP56581 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TdgP56581 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TdgP56581 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TdgP56581 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TdgP56581 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TdgP56581 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TdgP56581 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TdgP56581 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TdgP56581 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TdgP56581 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TdgP56581 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TdgP56581 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TdgP56581 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TdgP56581 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TdgP56581 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TdgP56581 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TdgP56581 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TdgP56581 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TdgP56581 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TdgP56581 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TdgP56581 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TdgP56581 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TdgP56581 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TdgP56581 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TdgP56581 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TdgP56581 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TdgP56581 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TdgP56581 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TdgP56581 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TdgP56581 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TdgP56581 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TdgP56581 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TdgP56581 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TdgP56581 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TdgP56581 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TdgP56581 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TdgP56581 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TdgP56581 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TdgP56581 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TdgP56581 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TdgP56581 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TdgP56581 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TdgP56581 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TdgP56581 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TdgP56581 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TdgP56581 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TdgP56581 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TdgP56581 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TdgP56581 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TdgP56581 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TdgP56581 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TdgP56581 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TdgP56581 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TdgP56581 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TdgP56581 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TdgP56581 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TdgP56581 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TdgP56581 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TdgP56581 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TdgP56581 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TdgP56581 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TdgP56581 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TdgP56581 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TdgP56581 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TdgP56581 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TdgP56581 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TdgP56581 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms