Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd38P56528 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd38P56528 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd38P56528 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd38P56528 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd38P56528 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms