Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms