Protein–RNA interactions for Protein: P55288

Cdh11, Cadherin-11, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh11P55288 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh11P55288 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh11P55288 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms