Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab8aP55258 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms