Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms