Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms