Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms