Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fgd1P52734 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgd1P52734 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms