Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp10P52479 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp10P52479 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp10P52479 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp10P52479 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp10P52479 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp10P52479 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms