Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr1cP52432 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms