Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RorcP51450 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RorcP51450 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RorcP51450 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RorcP51450 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RorcP51450 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RorcP51450 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RorcP51450 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RorcP51450 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RorcP51450 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RorcP51450 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RorcP51450 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RorcP51450 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RorcP51450 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RorcP51450 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RorcP51450 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RorcP51450 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RorcP51450 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RorcP51450 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RorcP51450 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RorcP51450 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RorcP51450 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RorcP51450 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RorcP51450 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RorcP51450 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RorcP51450 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RorcP51450 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RorcP51450 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RorcP51450 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RorcP51450 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RorcP51450 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RorcP51450 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RorcP51450 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RorcP51450 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RorcP51450 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RorcP51450 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RorcP51450 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RorcP51450 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RorcP51450 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RorcP51450 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RorcP51450 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RorcP51450 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RorcP51450 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RorcP51450 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RorcP51450 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RorcP51450 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RorcP51450 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RorcP51450 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RorcP51450 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RorcP51450 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RorcP51450 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RorcP51450 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RorcP51450 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RorcP51450 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RorcP51450 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RorcP51450 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RorcP51450 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RorcP51450 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RorcP51450 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RorcP51450 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RorcP51450 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RorcP51450 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RorcP51450 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RorcP51450 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RorcP51450 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RorcP51450 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RorcP51450 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RorcP51450 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RorcP51450 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RorcP51450 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RorcP51450 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RorcP51450 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RorcP51450 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RorcP51450 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RorcP51450 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RorcP51450 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RorcP51450 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RorcP51450 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RorcP51450 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RorcP51450 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RorcP51450 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RorcP51450 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RorcP51450 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RorcP51450 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RorcP51450 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RorcP51450 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RorcP51450 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RorcP51450 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RorcP51450 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RorcP51450 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RorcP51450 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RorcP51450 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RorcP51450 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RorcP51450 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RorcP51450 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RorcP51450 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RorcP51450 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RorcP51450 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RorcP51450 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RorcP51450 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms