Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms