Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FmodP50608 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FmodP50608 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FmodP50608 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FmodP50608 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FmodP50608 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FmodP50608 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FmodP50608 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FmodP50608 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FmodP50608 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FmodP50608 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FmodP50608 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FmodP50608 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FmodP50608 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FmodP50608 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FmodP50608 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FmodP50608 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FmodP50608 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FmodP50608 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FmodP50608 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FmodP50608 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FmodP50608 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FmodP50608 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FmodP50608 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FmodP50608 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FmodP50608 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FmodP50608 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FmodP50608 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FmodP50608 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FmodP50608 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FmodP50608 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FmodP50608 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FmodP50608 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FmodP50608 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FmodP50608 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FmodP50608 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FmodP50608 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FmodP50608 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FmodP50608 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FmodP50608 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FmodP50608 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FmodP50608 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FmodP50608 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FmodP50608 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FmodP50608 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FmodP50608 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FmodP50608 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FmodP50608 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FmodP50608 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FmodP50608 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FmodP50608 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FmodP50608 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FmodP50608 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FmodP50608 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FmodP50608 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FmodP50608 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FmodP50608 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FmodP50608 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FmodP50608 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FmodP50608 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FmodP50608 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FmodP50608 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FmodP50608 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FmodP50608 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FmodP50608 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FmodP50608 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FmodP50608 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FmodP50608 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FmodP50608 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms