Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc13P50207 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms