Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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