Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CitP49025 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CitP49025 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CitP49025 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CitP49025 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CitP49025 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CitP49025 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CitP49025 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CitP49025 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CitP49025 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CitP49025 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CitP49025 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CitP49025 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CitP49025 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CitP49025 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CitP49025 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CitP49025 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CitP49025 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CitP49025 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CitP49025 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CitP49025 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CitP49025 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CitP49025 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CitP49025 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CitP49025 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CitP49025 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CitP49025 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CitP49025 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CitP49025 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CitP49025 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CitP49025 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CitP49025 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CitP49025 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CitP49025 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CitP49025 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CitP49025 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CitP49025 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CitP49025 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CitP49025 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CitP49025 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CitP49025 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CitP49025 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CitP49025 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CitP49025 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CitP49025 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CitP49025 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CitP49025 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CitP49025 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CitP49025 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CitP49025 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CitP49025 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CitP49025 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CitP49025 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CitP49025 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CitP49025 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CitP49025 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CitP49025 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CitP49025 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CitP49025 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CitP49025 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CitP49025 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CitP49025 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CitP49025 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CitP49025 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CitP49025 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CitP49025 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CitP49025 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CitP49025 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CitP49025 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CitP49025 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CitP49025 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CitP49025 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CitP49025 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CitP49025 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CitP49025 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CitP49025 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CitP49025 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CitP49025 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CitP49025 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CitP49025 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CitP49025 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CitP49025 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CitP49025 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CitP49025 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CitP49025 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CitP49025 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CitP49025 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CitP49025 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CitP49025 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CitP49025 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CitP49025 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CitP49025 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CitP49025 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CitP49025 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CitP49025 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CitP49025 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CitP49025 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CitP49025 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CitP49025 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CitP49025 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms