Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3P48787 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3P48787 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3P48787 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3P48787 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3P48787 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3P48787 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3P48787 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3P48787 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3P48787 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3P48787 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3P48787 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3P48787 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3P48787 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3P48787 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3P48787 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3P48787 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3P48787 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3P48787 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3P48787 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnni3P48787 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms