Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GdnfP48540 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GdnfP48540 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GdnfP48540 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms