Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms