Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gli1P47806 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gli1P47806 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gli1P47806 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gli1P47806 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gli1P47806 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms