Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic1P46684 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic1P46684 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic1P46684 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic1P46684 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic1P46684 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic1P46684 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic1P46684 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic1P46684 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic1P46684 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic1P46684 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic1P46684 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic1P46684 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic1P46684 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic1P46684 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic1P46684 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic1P46684 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms