Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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