Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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