Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VhlP40338 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
VhlP40338 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VhlP40338 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VhlP40338 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VhlP40338 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VhlP40338 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VhlP40338 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VhlP40338 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VhlP40338 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VhlP40338 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VhlP40338 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VhlP40338 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VhlP40338 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VhlP40338 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VhlP40338 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VhlP40338 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VhlP40338 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VhlP40338 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VhlP40338 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VhlP40338 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VhlP40338 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VhlP40338 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VhlP40338 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VhlP40338 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VhlP40338 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VhlP40338 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VhlP40338 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VhlP40338 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VhlP40338 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
VhlP40338 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VhlP40338 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VhlP40338 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VhlP40338 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VhlP40338 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VhlP40338 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VhlP40338 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VhlP40338 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VhlP40338 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VhlP40338 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VhlP40338 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VhlP40338 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VhlP40338 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VhlP40338 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VhlP40338 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VhlP40338 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VhlP40338 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VhlP40338 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VhlP40338 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VhlP40338 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VhlP40338 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VhlP40338 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VhlP40338 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
VhlP40338 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VhlP40338 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VhlP40338 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VhlP40338 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VhlP40338 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VhlP40338 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VhlP40338 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VhlP40338 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
VhlP40338 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VhlP40338 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
VhlP40338 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
VhlP40338 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VhlP40338 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VhlP40338 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VhlP40338 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VhlP40338 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VhlP40338 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VhlP40338 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VhlP40338 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VhlP40338 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
VhlP40338 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VhlP40338 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VhlP40338 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms