Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tjp1P39447 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tjp1P39447 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tjp1P39447 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tjp1P39447 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tjp1P39447 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp1P39447 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp1P39447 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp1P39447 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp1P39447 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp1P39447 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp1P39447 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp1P39447 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp1P39447 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp1P39447 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp1P39447 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp1P39447 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp1P39447 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tjp1P39447 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tjp1P39447 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tjp1P39447 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tjp1P39447 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tjp1P39447 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tjp1P39447 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tjp1P39447 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms