Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf2P39429 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf2P39429 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf2P39429 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf2P39429 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf2P39429 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf2P39429 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms