Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpargP37238 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpargP37238 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpargP37238 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpargP37238 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpargP37238 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpargP37238 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpargP37238 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpargP37238 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpargP37238 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpargP37238 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpargP37238 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpargP37238 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpargP37238 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpargP37238 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpargP37238 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PpargP37238 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PpargP37238 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PpargP37238 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PpargP37238 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PpargP37238 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PpargP37238 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PpargP37238 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PpargP37238 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PpargP37238 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PpargP37238 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PpargP37238 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PpargP37238 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PpargP37238 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PpargP37238 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PpargP37238 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PpargP37238 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PpargP37238 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PpargP37238 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PpargP37238 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpargP37238 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpargP37238 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpargP37238 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpargP37238 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpargP37238 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpargP37238 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpargP37238 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpargP37238 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpargP37238 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpargP37238 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PpargP37238 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpargP37238 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpargP37238 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpargP37238 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpargP37238 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpargP37238 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpargP37238 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpargP37238 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PpargP37238 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpargP37238 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpargP37238 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpargP37238 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PpargP37238 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpargP37238 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpargP37238 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpargP37238 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpargP37238 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpargP37238 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpargP37238 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpargP37238 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpargP37238 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpargP37238 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PpargP37238 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpargP37238 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PpargP37238 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PpargP37238 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpargP37238 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpargP37238 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpargP37238 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpargP37238 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpargP37238 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpargP37238 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpargP37238 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PpargP37238 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PpargP37238 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PpargP37238 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PpargP37238 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PpargP37238 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PpargP37238 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PpargP37238 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PpargP37238 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PpargP37238 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PpargP37238 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PpargP37238 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PpargP37238 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PpargP37238 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpargP37238 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpargP37238 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpargP37238 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpargP37238 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpargP37238 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpargP37238 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpargP37238 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpargP37238 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpargP37238 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms