Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprkP35822 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprkP35822 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprkP35822 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprkP35822 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprkP35822 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtprkP35822 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtprkP35822 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtprkP35822 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtprkP35822 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PtprkP35822 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PtprkP35822 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PtprkP35822 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprkP35822 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprkP35822 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprkP35822 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms