Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc5P35689 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms