Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms